AutoGrid - Um sistema para análise quantitativa de imagens histológicas de forma semi-automática

O programa de computador aqui apresentado possibilita a aplicação da análise morfométrica de Weibel de forma semi-automática. Desse modo, o usuário necessita apenas fazer a seleção dos parâmetros a serem analisados, e indicar alguns marcadores de regiões na imagem que servem como referência para que os algoritmos realizem de forma automática a identificação completa de regiões por toda a imagem do tecido biológico em análise. Assim, o processo como um todo ganha bastante agilidade.
O sistema foi desenvolvido e testado utilizando-se um conjunto de imagens de porções glandulares da próstata, levando-se em consideração as regiões de lúmen, epitélio e estroma. O processo de semi-automatização é feito em duas etapas principais, a segmentação do epitélio e a segmentação do lúmen. Na primeira etapa, o epitélio é segmentado utilizando a "binarização" do canal azul ou vermelho da imagem, com valores escolhidos pelo usuário. Na segunda etapa, o usuário deve marcar pontos na imagem indicando a região do lúmen, a segmentação desta região é então realizada por meio de um algoritmo de inundação (flood fill). As regiões que não sofreram nenhuma segmentação nas etapas 1 e 2 são consideradas como estroma. A partir da segmentação, é realizada a aplicação da grade e contagem dos pontos de forma automática pelo software.