Gel Analysis APP - Molecular Analysis Automation System
Programa de computador
Registro concedido
BR 51 2024 003122-7
27/08/2024
03/09/2024
Não
Julio Cesar Polonio, Clenivaldo Pires da Silva, Mateus Filipe Tavares Carvalho, Yandre Maldonado e Gomes da Costa, Franklin Cesar Flores, Claudete Aparecida Mangolim
O Programa de Computador “Gel Analysis App - Molecular Analysis Automation System”, possui algoritmo baseado em Machine/Deep Learning capaz de detectar bandas em géis de eletroforese, podendo ler, interpretar e gerar resultados, a partir de marcadores moleculares.
O Gel Analysis App - Molecular Analysis Automation System vem proporcionar uma melhora no gerenciamento do tempo e na capacidade analítica de géis de eletroforese relativamente complexos em termos informativos (número de bandas). Objetivo do programa é realizar a leitura com pouca interversão humana, com interface fácil e intuitiva, apresentado uma nova alternativa às atuais soluções encontradas no mercado.
O Gel Analysis App - Molecular Analysis Automation System vem proporcionar uma melhora no gerenciamento do tempo e na capacidade analítica de géis de eletroforese relativamente complexos em termos informativos (número de bandas). Objetivo do programa é realizar a leitura com pouca interversão humana, com interface fácil e intuitiva, apresentado uma nova alternativa às atuais soluções encontradas no mercado.
TRL/MRL 4: Coloca-se em prática a prova de conceito, que consiste em sua aplicação em ambiente similar ao real, podendo constituir testes em escala de laboratório.
No Gel Analysis APP, tem seguintes funcionalidades para interpretações de géis de eletroforese:
- Recorte de imagens;
- Aplicação de filtros de suavização;
- Transformação das imagens em tons de cinza;
- Ajuste de cores, brilhos e nitidez;
- É capaz de ler, interpretar e analisar automaticamente resultados obtidos por meio de imagens digitalizadas de géis de eletroforese;
- Reconhecer Poços e Marcadores com muita precisão;
- Gerar matriz de similaridade e dissimilaridade;
- Gerar árvores de filogenéticas.
- Recorte de imagens;
- Aplicação de filtros de suavização;
- Transformação das imagens em tons de cinza;
- Ajuste de cores, brilhos e nitidez;
- É capaz de ler, interpretar e analisar automaticamente resultados obtidos por meio de imagens digitalizadas de géis de eletroforese;
- Reconhecer Poços e Marcadores com muita precisão;
- Gerar matriz de similaridade e dissimilaridade;
- Gerar árvores de filogenéticas.
Atualmente, a leitura e interpretação de géis de eletroforese é realizada de forma manual ou através de software que, utilizando métodos de processamento de imagens, exigem conhecimentos específicos e ainda o reconhecimento de bandas é de forma manual ou ainda por processamento de imagens. No entanto, o programa de computador “Gel Analysis App - Molecular Analysis Automation System” vem auxiliar o pesquisador na leitura de géis de eletroforese fazendo uso de inteligência artificial para realizar identificações e anotações automatizadas do que são poços, marcadores de peso e bandas específicamente). Além disso, é escrito em Python/Kivy, permitindo um desenvolvimento de uma interface de fácil manuseio e intuitiva para diversos sistemas operacionais, como Windows, Linux e MacOS.
