Uma das maiores bibliotecas do interior do Brasil, com cerca de 540 mil exemplares em acervo e acesso a mais de 37 mil periódicos eletrônicos do portal da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (Capes), a Biblioteca Central dos Estudantes (BCE) da UEM recebe, em média, 2.500 usuários por dia.
No câmpus sede, o sistema conta com outras quatro bibliotecas setoriais, incluindo a do hospital universitário. Nos câmpus regionais, existem as setoriais em Ivaiporã (CRV), Cianorte (CRC), Cidade gaúcha (CAR), Goioerê (CRG) e Umuarama.
A BCE disponibiliza o aplicativo SophiA Biblioteca, que executa vários serviços sem precisar ir à biblioteca. Três máquinas de autoatendimento agilizam os processos para emprestar, renovar e devolver obras.